1996-2001. European Forest Institute, Joensuu, Finland. Project 619. Dynamic model of mixed stand/soil system in European boreal forests. Project leader Dr.O.G.Chertov (St.-Petersburg State University).
1998-2000. European Forest Institute (Joensuu, Finland), project 649. Modelling energy-, carbon-, and nutrient budgets for forestry. Project leader Prof.Dr.S.Kellomaki (University of Joensuu, Finland).
1999-2002. Team leader in INTAS OPEN-97-30255 project “Forest Models for Sustainable Forest Management (FORMOD)».
Project coordinator from INTAS countries Prof.Dr.G.M.G.Mohren (Wageningen, The Netherlands).
1999-2002. EU-Project CT98-4124 “Relationships Between Recent Changes of Growth and Nutrition of Norway Spruce, Scots Pine, and European Beech Forests in Europe”, Project leader Dr.T.Karjalainen (European Forest Institute, Finland).
2000. European Forest Institute, Joensuu, Finland, Project 571, “Compiling a review on the computer-oriented biodiversity issues in Europe (including Russia), Project leader A.S.Komarov.
2002-2004. Team leader in INTAS OPEN-01-0512 project "Biological and pedological evolutionary trends in benchmark podzolic ecosystems under changing climate and anthropic influence PODZOL)"
Project coordinator from INTAS countries Prof.Dr.E. Zanini, (Torino, Italy).
2002-2005. Team leader in INTAS OPEN-01-0633 project «Silvicultural Systems for Sustainable Forest Resource Management (SILVICS)»
Project coordinator from INTAS countries Prof.Dr.G.M.G.Mohren (Wageningen, The Netherlands).
2004-2007. Team leader in INCO Copernicus project “Impacts and risks from anthropogenic disturbances on soils, carbon dynamics and vegetation in podzolic ecosystems (OMRISK)”. Contract no.: 013388
Project coordinator from Europe INTAS countries Prof.Dr.E. Bonifacio, (Torino, Italy).
2009-2012. Межакадемическое сотрудничество между Российской академией наук и Болгарской Академией наук по совместной теме № 11 «Математическое моделирование динамики органического вещества почвы в горных лесных почвах»
2010-2012. COST ACTION FP0804 - Forest management decision support systems – FORSYS
2010-2012. Межакадемическое сотрудничество между Российской академией наук и Академией наук Финляндии по теме «Управление бореальными лесами при изменениях климата: моделирование роста древостоев основных бореальных лесных видов и соответствующего развития почв (проект 3)»
2010-2012. МНТЦ #4028 Quantification of carbon stocks and pollution loads in Northern Latitude Soils: Assessment of potential release resulting from Climate Change
2011-2013. Межакадемическое сотрудничество между РАН и Академией наук Финляндии. Проект 3 «Управление бореальными лесами при изменениях климата: моделирование роста древостоев основных бореальных лесных видов и соответствующего развития почв».
2011-2015. ECLAIRE - Effects of Climate Change on Air Pollution Impacts and Response Strategies for European Ecosystems ", Grant agreement no: 282910.
2012-2014. Межакадемическое сотрудничество между РАН и Болгарской АН, проект № 19 РАН / 38 БАН «Математическое моделирование динамики органического вещества горных лесных почв при климатических изменениях».
2012. «Adaptation of boreal forest management in the changing climate: modelling forest stand and soil development for main boreal tree species», Academy of Finland Collaboration Programme (projects 140766, 257845).
2012. FP7 Cooperation Work Programme «Effects of climate change on air pollution impacts and response strategies for European ecosystems» (ECLAIRE).
1996-2000. Программа Президиума РАН "Физико-химические основы биологии, медицины и биотехнологии"
2002-2004. ФЦНТП Глобальные изменения климата и их вероятные последствия: Тема 10 «Методы оценки пулов и потоков углерода и парниковых газов в наземных экосистемах, обоснование механизмов их регулирования».
2003-2009. Программа Президиума РАН «Изменения природной среды и климата: природные катастрофы».
2010-2014. Программа 4 Президиума РАН «Оценка и пути снижения негативных последствий экстремальных природных явлений и техногенных катастроф, включая проблемы ускоренного развития атомной энергетики».
2008-2009. Государственный контракт № 02.512.11.2258 от 7 июля 2008 года. Головной исполнитель: Институт биоорганической химии РАН, Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения РАН – исполнитель по теме: «Прогнозирование свойств трансгенных растений осины и березы по сравнению с обычными формами в условиях плантационного лесоразведения путем математического моделирования». Ответственный исполнитель зав. лаб., д.б.н. А.С.Комаров.
2012-2013. Государственный контракт № 1.519.11.6043 от 20.06.2012 г. по теме: «Трансгенные растения осины и березы с заданными характеристиками как биологические модели для прогнозирования изменений круговоротов азота и углерода в искусственных лесных экосистемах». Ответственный исполнитель проф., д.б.н., зав. лаб. А.С.Комаров, с.н.с., к.г.н. С.С.Быховец, с.н.с., к.б.н. Е.В.Зубкова, н.с., к.б.н. В.Н.Шанин
2013. Государственный контракт №14.515.11.0014 от 14.03.2013 г. по теме «Разработка научно-технических основ оценки биоразнообразия лесов России и принципов системы построения его мониторинга». Ответственный исполнитель проф., д.б.н., зав.лаб. А.С.Комаров, в.н.с., к.б.н. М.В.Бобровский, в.н.с., к.г.н. И.В.Припутина, с.н.с., к.г.н. С.С.Быховец, н.с., к.б.н. В.Н.Шанин.
2002-2004. Грант РФФИ, № 02-04-48965. "Анализ динамики популяций и сообществ травянистых растений при различных изменениях внешней среды и антропогенных воздействиях".
2004-2006. Грант РФФИ-Минпромнаука Московской обл. № 04-05-97221 «Оценка влияния эмиссии соединений азота на продукционные процессы и сток углерода в лесах Подмосковья при разных сценариях лесопользования: модельный подход».
2005-2007. Грант РФФИ 05-04-49284 "Система имитационных моделей круговорота углерода для анализа влияния катастрофических воздействий на лесные экосистемы"
2005. Грант РФФИ 05-04-58042-г «Организация и проведение 5-ой европейской конференции по моделированию в экологии».
2009-2011. Грант РФФИ 09-04-01209 «Разработка математических моделей динамики пулов углерода, азота и кальция в лесных почвах».
2012-2014. Грант РФФИ 12-04-01269 «Сравнительный анализ некоторых широко распространенных моделей динамики органического вещества и пулов элементов питания растений в почве».
2013. Грант РФФИ 13-04-06111 «Проект организации и проведения Третьей Национальной конференции с международным участием «Математическое моделирование в экологии».
2015. Грант РФФИ 15-04-20232 «Проект организации и проведения Четвертой Национальной конференции с международным участием «Математическое моделирование в экологии».
2015-2017. Грант 15-04-08712 А «Моделирование и анализ динамики популяций и сообществ кустарничков при изменении условий произрастания